斑馬魚幼體高通量圖像采集自動(dòng)操作系統(tǒng)
VAST BioImager™ Platform 
 
VAST BioImager系統(tǒng)是門為2-7天幼體斑馬魚的高通量圖像采集而設(shè)計(jì)。該系統(tǒng)是在美國麻省理工學(xué)院Yanik實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的技術(shù)的基礎(chǔ)上發(fā)展而來。VAST BioImager在采集圖像之自動(dòng)完成斑馬魚幼體裝載、定位、旋轉(zhuǎn)等操作，避免了在進(jìn)行高通量圖像采集時(shí)對斑馬魚幼體人工操作的時(shí)間損耗和冗長的步驟。同時(shí)它也是一個(gè)組裝式和可拓展的平臺(tái)，能安裝在多種直立復(fù)式顯微鏡或者立體顯微鏡上進(jìn)行高分辨率、細(xì)胞水平上的圖像采集。


型號(hào)：VAST BioImager

產(chǎn)品特點(diǎn)：
· 適用于高通量&高內(nèi)涵篩選
· 可安裝在多種直立復(fù)式顯微鏡或者立體顯微鏡上
· 可安裝在熒光顯微鏡上進(jìn)行熒光圖像采集
· 配合高階分析軟件，可實(shí)現(xiàn)對斑馬魚的高精度定位和高分辨率成像
· 可選配LP Sampler自動(dòng)加樣器，可實(shí)現(xiàn)從96孔板中取樣，傳送斑馬魚幼體到VAST系統(tǒng)進(jìn)行圖像采集

主要功能：
· 為模式生物研究而設(shè)是斑馬魚研究的有力工具
· 自動(dòng)處理圖像采集斑馬魚幼體的各種操作
· 避免人工操作的時(shí)間損耗和冗長的步驟
· 在軟件上點(diǎn)擊“Load one Fish”，VAST就會(huì)裝載好一個(gè)斑馬魚幼體
· 系統(tǒng)可將斑馬魚幼體進(jìn)行360°旋轉(zhuǎn)定位，從側(cè)面、背面或者其他方向進(jìn)行圖像采集

高分辨率顯微鏡載物臺(tái)和安裝套件
VAST配合實(shí)驗(yàn)室的顯微鏡一起使用，一旦使用機(jī)載攝像頭定位幼蟲，VAST內(nèi)部光源就會(huì)關(guān)閉，并且可以使用顯微鏡的光學(xué)器件和攝像頭捕獲高分辨率圖像；
在配備熒光功能的顯微鏡上安裝 VAST 可以收集熒光圖像；



多角度成像
將斑馬魚幼體進(jìn)行360°旋轉(zhuǎn)定位，操作者可根據(jù)自己的意愿選擇方向，側(cè)面、背面或者其他方向進(jìn)行圖像采集


高階版 VAStomography™ 軟件
能夠在幾分鐘內(nèi)生成3D光學(xué)投影斷層掃描 (OPT)
選定感興趣區(qū)域的體積、形狀和位置數(shù)據(jù)集
使用 VolView/ParaView 進(jìn)行 3D 可視化
使用 MATLAB/Python 進(jìn)行數(shù)據(jù)處理

從用 Col2-H2a-mCherry 標(biāo)記的 4 dpf 斑馬魚幼蟲的熒光圖像構(gòu)建斷層掃描
A 腹面觀，B 側(cè)視圖，C 用VASTomography 軟件對同一條魚進(jìn)行3D斷層掃描


手動(dòng)加樣器
手持式流通式移液器通過單擊按鈕，將斑馬魚裝載到 VAST中


LP Sampler自動(dòng)進(jìn)樣器
能夠?qū)崿F(xiàn)對多孔板樣品的自動(dòng)化加樣

完整的圖像采集系統(tǒng)
VAST斑馬魚高通量圖像采集系統(tǒng)可配合LP Sampler組成一套更加完整的高通量拍照平臺(tái)
能夠?qū)崿F(xiàn)從多孔板自動(dòng)進(jìn)樣到顯微鏡成像平臺(tái)




VAST BioImager的部分文章：
·Nature Methods, 2010, 7 600-601 ａnd 634-636, Carlos Pardo-Martin, Tsung-Yao Chang, Bryan Kyo Koo, Cody L Gilleland, Steven C Wasserman ａnd Mehmet Fatih Yanik

·Lab Chip, 2012, 12 711-716, Tsung-Yao Chang, Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Carolina Wählby ａnd Mehmet Fatih Yanik

·Nature Communications, 4, Article number:1467, doi:10.1038/ncomms2475, Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Jaime Medina, Peter M. Eimon, Carolina Wählby, Mehmet Fatih Yanik


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